各类审计监督是及时发现税务机关在税收执法、预算执行、内部财务管理方面存在问题与薄弱环节，防范执法和管理风险的有效手段。建立有效机制，不折不扣地落实好审计整改工作，是确保审计监督取得实效的有力措施。从河南省国税系统税收执法监督与财务管理监督的实践看，要注意从制定明确的整改目标、明确整改的责任主体和整改时限、建立整改的跟踪管理机制三个方面着手做好审计整改工作。
制定明确的整改目标是确保审计整改效果的关键。对于审计整改，应按照三个层次制定整改目标。第一个层次的目标是所有的问题都必须得到有效的纠正。如对违规少征的税款、滞纳金等应依法补征；对不符合财务核算要求的应调整相应的会计科目，对违反财经纪律的应依据财经法规作出相应处理；对税收执法与内部财务管理中发现的严重违规违纪问题应追究相关人员的责任。第二个层次的目标是注意以点带面、举一反三，实现全面纠错。对于审计检查中发现的问题，不能满足于就问题纠正问题，而应针对发现的问题，拓展审计整改的广度和深度，使存在的问题得到全面、彻底纠正。河南省国税局先后针对税收执法督察和审计监督中发现的普通发票管理、企业所得税和增值税优惠政策执行等方面的问题在全系统布置整改，取得明显成效。实现全面整改纠错还应对一些苗头性问题进行延伸审计检查。如审计署在审计检查中发现河南省个别基层国税机关存在为追求税收征管质量考核指标随意修改税收管理系统数据的现象，省国税局为此组织安排全省系统对有关数据进行深入、全面的检查，发现税收征管系统与金税工程防伪税控系统之间在衔接上存在管理漏洞，及时采取措施进行了强化管理。第三个层次的目标是注意总结问题出现的规律，通过完善税收管理制度和内部财务管理制度，建立长效管理机制来防止问题的重复出现。如河南省国税局针对审计署对几个县市国税机关为小规模纳税人代开增值税专用发票审计检查中发现的管理漏洞，对全省代开增值税专用发票的情况进行了全面检查，完善相关制度，从一般纳税人认定管理、代开专用发票管理和进项抵扣管理等方面对矿产品代开增值税发票实施综合治理。