目前，商业企业长期存在的增值税负申报问题，已成为新税制运行过程中一个突出的问题。形成这个问题的主要原因有以下几方面：

一、延伸批发，高进低批，利润返还。目前，大部分商业批发公司为占领批发市场，下设若干批发门市部，在核算形式上有的实行报账、报表制；有的实行费用包于班组承包制。这些门市部大部分办理了税务登记，实行独立核算，自行纳税。但由于多数批发门市部账目不健全，财务人员素质不高，税务部门对其实行了定额征收，商业批发公司正是利用了这个特点，对其下属的批发部实行低价批发，销售差价收回，从中偷税。

二、销售回扣，红字冲减销售。在税务检查中，我们不难发现，有的批发企业为达到促销目的，对购货方的采购人员实行按一定比例给回扣，采取开票红字冲减销售，以达到促销的目的。从而偷漏了税收。

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