一、建立个人所得税管理信息系统，有利于建立健全工作监督机制。个人所得税管理信息系统的建立，有利于统一所覆盖范围内各辖区的征管标准，有利于从源头和机制上预防与治理腐败。同时，对个人所得税代扣代缴单位以及日后在联网基础上对社会保障基金的征缴单位，均可形成监督制约机制，充分体现“内外兼治、以内促外”的治税思想，对于推动纳税人依法履行纳税义务、税务机关依法行政、建立严格高效的税收征管体系，是一种积极有效的推动。
二、建立个人所得税管理信息系统，是依法治税的需要。个人所得税管理信息系统可以通过部门间数据资源共享和逐步实现代扣代缴单位纳税明细申报，适应个人所得税制发展，加强对个人收入管理，便于准确及时纳税。对于进一步规范代扣代缴单位和纳税人纳税申报，增强依法治税能力和税务控管的有效性，不断提高个人所得税申报率、入库率和实际代扣代缴率，减少代扣代缴单位不如实申报以及对漏征漏管户等征收管理问题，均具有非常积极的作用。